進行輸尿管軟鏡碎石手術，首先要清洗會陰部，消毒會陰部，然后通過輸尿管鏡放入導絲，放到有結石的輸尿管里。觀察結石部位，觀察輸尿管的擴張程度，之后把導絲放入輸尿管軟鏡里。超滑導絲固定以后要拔出輸尿管鏡，觀察鏡取出以后，放入輸尿管軟鏡的鞘，順著導絲放入鞘，緩慢旋轉進入，一直到腎盂、輸尿管交叉口，然后開始把輸尿管軟鏡順著鏡鞘放入。此時要一邊注水，一邊放鏡，觀察結石，如腎盂結石、輸尿管結石、腎盞結石，進行碎石、沖洗。把結石粉末化、粉碎以后，大的結石可以通過網籃取出，小的結石可以自行排出。在碎石結束以后，拔出輸尿管軟鏡，拔出鏡鞘，然后順著導絲放入F4.7的雙J管，引流腎臟尿液，近端在輸尿管、腎盂交界處，遠端在膀胱處，最后拔出導絲，手術完成。