乳腺癌靶向治療藥物相比放化療藥物，毒副作用較小。例如乳腺癌靶向治療藥物赫賽汀，使用后它的胃腸道反應(yīng)和骨髓反應(yīng)很小，但是它具有一定的心臟毒性，極少數(shù)嚴(yán)重的患者可能發(fā)生死亡。在患者進(jìn)行靶向治療之前要做心臟評(píng)估測(cè)試，在治療期間也要進(jìn)行心臟監(jiān)測(cè)。醫(yī)生根據(jù)患者的心臟情況來(lái)判定患者是否適合此種靶向治療藥物，以及何時(shí)開(kāi)始或終止治療。另外一種乳腺癌靶向藥物依維莫司的副作用主要是嚴(yán)重的口腔黏膜反應(yīng)。