臨床上多系統(tǒng)萎縮病因尚未明確，仍在研究調(diào)查中。病理中發(fā)現(xiàn)多系統(tǒng)萎縮的特征性病理改變，為少突膠質(zhì)細胞中發(fā)現(xiàn)有α-突觸核蛋白包涵體，同種包涵體亦出現(xiàn)于路易體癡呆或帕金森患者中，以上提示多系統(tǒng)萎縮類疾病可能與α-突觸核蛋白的聚集有關(guān)。多系統(tǒng)萎縮有16%左右的遺傳相關(guān)性，除遺傳因素外，有機溶劑、重金屬接觸等環(huán)境因素也可誘使多系統(tǒng)萎縮發(fā)病。