統(tǒng)稱的這類疾病叫胃腸間質(zhì)瘤，胃腸間質(zhì)瘤最好發(fā)的部位是在胃，然后是在小腸。胃的發(fā)生率在60%-70%，但小腸在20%-30%。除上述最主要的發(fā)生部位之外，直腸還有食管等部位也可以有少量的病例發(fā)生。因此腸間質(zhì)瘤就是主要發(fā)生在十二指腸、小腸和直腸的原發(fā)性的胃腸間質(zhì)瘤，統(tǒng)稱為腸間質(zhì)瘤。腸間質(zhì)瘤總體相比較胃間質(zhì)瘤，預(yù)后相對要差、惡性程度相對要高，更容易發(fā)生復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的問題。發(fā)生于腸的間質(zhì)瘤，治療效果也比胃間質(zhì)瘤相應(yīng)要差。因此在定義極低危、低危、中危和高危4個等級時，除腫瘤大小、腫瘤核分裂象的數(shù)量外，原發(fā)部位也是比較重要的影響因素。因此原發(fā)于腸的間質(zhì)瘤，惡性程度相對要高、治療時間會相對比較長。比如同樣都是大小5cm以上的胃間質(zhì)瘤和腸間質(zhì)瘤，危險程度劃級就可能會不同。