早晨起來喉嚨有痰原因主要為慢性咽喉炎、支氣管炎、胃食道反流，具體如下：1、慢性咽喉炎：慢性咽喉炎患者晚上睡覺時由于較為干燥，可引起咽喉部黏膜分泌物過多，因此早上起來有痰液。需進行對癥藥物治療，如可服用中成類藥物中的一清膠囊或甘桔冰梅片以清熱去火，可消除喉嚨有痰液的癥狀；2、支氣管炎：支氣管炎的患者經過一夜的呼吸，次日早晨起來喉嚨中可有痰液；3、胃食道反流：若有慢性胃炎、胃食道反流，胃酸可刺激咽喉部黏膜，可出現咽喉部黏膜分泌物過多，也可出現晨起痰液過多。若每日晨起感喉嚨中有痰液，應檢查咽喉部且追問病人病史，詢問是否患慢性胃炎。若患者近期有頻繁咳嗽、上呼吸道感染、支氣管炎等癥狀，則需分別對癥治療。