碘伏跟碘酒的最大不同，在于溶劑的不同。碘酒的溶劑就是酒精，碘伏的溶劑是有機的咯烷酮。對于兩種溶劑最大的不同地方，就在于碘伏是一種有機碘，在跟碘結合在一起以后，其實其刺激就不大。當消毒以后，對整個黏膜的刺激就很小。碘酒用了將近有150-200年，是常用且具有殺菌效果的制劑。此化學制劑的最大缺點，就是會造成黏膜的強烈刺激，就相當于把酒精直接倒在傷口上，其產生的反應是一模一樣。雖然碘酒用了較長時間，消毒、殺菌的范圍也非常好，但是現在仍然用碘伏來替代。最主要的原因，就是對于腸道黏膜，或者口腔黏膜，如果直接用碘酒，對整個傷口的刺激非常大，也會造成患者的疼痛。有時換傷口時也多數會采用碘伏，而不是碘酒。因為酒精對于整個細胞的生長，也有刺激作用，甚至抑制作用。因此選用更加刺激輕微的消毒制劑來殺滅細菌，是大勢所趨。