殺滅幽門螺桿菌常用的方法是四聯療法，一般包含一個PPI制劑，或者H2受體阻滯劑，加2種抗生素，加一個鉍制劑，療程是10-14天，對于幽門螺桿菌感染的清除率在93%以上。常用的治療方案有奧美拉唑、雷貝拉唑、泮托拉唑，或者鹽酸雷尼替丁，或者法莫替丁，加克拉霉素、阿莫西林、枸櫞酸鉍鉀，或者2種抗生素可以換為呋喃唑酮加四環(huán)素，四聯療法的治療方案，可以根據患者的情況而定。因為四聯療法的副作用比較大，需要因人而異，比如有些病人應用阿莫西林后，有過敏的情況，可以將阿莫西林換為呋喃唑酮加滅滴靈，或者是克拉霉素。反應比較重的患者，也可以改換為呋喃唑酮加滅滴靈等治療方法。有些人通過四聯療法后反應比較大、副作用比較明顯，有些人反應比較輕微、副作用比較小，如果反應特別大的患者，可以更換藥物，或者由三聯藥物改為四聯療法治療。如果副作用小，一般情況下大多能夠忍受。