耐藥菌感染可能可以治好，但也可能的確很難治，取決于耐藥菌感染的耐藥性、耐藥菌感染所在的部位以及耐藥菌感染部位對人體造成的影響。如果耐藥菌感染是包莖嚴重的情況，比如幾乎對現有的抗生素全部耐藥，手里沒有武器將耐藥菌殺滅，此時便比較難治好。耐藥菌感染的部位對人體而言比較關鍵和重要，比如腦部感染這時要將其治好，難度也就大得多。而如果耐藥菌感染并不是對所有的藥物都耐藥，只是對一部分藥物耐藥，這時還是有機會選擇適合的抗生素，這種情況下治療的難度當然就會小得多。此外，還有的時候耐藥菌感染的部位在比較容易夠得到的部位，比如皮膚或者軟組織膿腫，便比較方便將膿腫引流出來或者將局部病灶清除掉，這時治療難度也就相對會小。