正常人基因里面都含有唇腭裂的風險基因，但是多數(shù)情況下不會發(fā)生唇腭裂。目前的調(diào)查研究顯示，父母或者雙方直系親屬三代以內(nèi)有類似疾病的患者，患兒的遺傳幾率會大大增加。同時唇腭裂的發(fā)生也與其他的因素，如營養(yǎng)因素缺乏葉酸，還有輻射，孕婦懷孕尤其前三個月濫用藥物如抗生素、止痛劑等因素都是有關(guān)系的。所以從遺傳角度，父母雙方直系親屬有類似顯性癥狀表現(xiàn)的遺傳幾率更大。