若傷口較表淺，常兩周左右時間可愈合；若切開排膿，則一周左右時間膿腫可排除徹底；若較復雜的肛周膿腫，一次性處理需4-5周甚至1-2月；也與患者自身修復能力有關，糖尿病患者傷口愈合較慢，年輕患者愈合較快。因此，肛周膿腫術后愈合時間常不確定，短則兩周，長則1-2月，其愈合時間需視膿腫深度、面積、廣度、手術方式而定。