肛瘺的保守治療可使用肛周用藥，包括坐浴、栓劑、膏劑暫緩癥狀，消除肛周的炎癥，但根治還需手術(shù)治療。低位單純性肛瘺可在術(shù)中找到肛隱窩，剔除瘺管即可；而高位復(fù)雜性肛瘺需掛線治療，以保護(hù)肛門括約肌功能，預(yù)防術(shù)后造成大便失禁。肛瘺術(shù)后需住院，使用預(yù)防性抗生素及每天換藥處理傷口，可正常排便，建議高纖維飲食預(yù)防大便干結(jié)。