深呼吸肚子疼的原因，主要包括以下幾種：1、腹腔臟器疾病：如膽囊炎，由于在深呼吸時(shí)大量氣體吸入肺部使膈肌位置下移，會(huì)擠壓腹腔空間，導(dǎo)致壓力升高、空間變小，對(duì)腹腔臟器產(chǎn)生一定的影響，此時(shí)則會(huì)出現(xiàn)深呼吸時(shí)右上腹疼痛，或伴有向右側(cè)肩胛放射的針刺樣疼痛。若中年人經(jīng)常出現(xiàn)上述情況，并伴有不明原因的消瘦，需要及時(shí)到醫(yī)院就診并進(jìn)行腹部CT的增強(qiáng)掃描，排除腫瘤問(wèn)題，以免貽誤病情；2、腸道疾病：在深呼吸時(shí)由于壓力改變會(huì)導(dǎo)致神經(jīng)反射，從而出現(xiàn)腹痛的情況，如胰腺炎患者也會(huì)出現(xiàn)上述情況。